Parken ligger ved foten av The Greater Rift Valley og dekker 330 km2.  200 km2 består av innsjø, resten utgjør en stripe langs innsjøen og Rift Valley-skråningen. Det er en frodig tropisk vegetasjon langs skråningen, som går over i savanne langs sjøen. Manyara er berømt for sine klatrende løver og har ellers et variert dyreliv som man kan se innenfor et forholdvis lite område. Innsjøen har flodhester, flamingoer og et rikt fugleliv.